ولحنين مؤلفات كثيرة في الطب العام، وطب العيون الخاصة، ومنها الأدوية، والرياضيات. والفلك، والفلسفة، موسيقى، وله الفضل فى نقل كثير من كتب اليونان إلى العربية.
ومؤلفات حنين في الكحل
(العين) هي العشر مقالات في العين، ويُعد هذا
الكتاب أقدم الكتب العربية التي تعلم طب العيون، بشكل منهجي تعليمي، وفيه أقدم
صورة لتشريح العين، وقد اهتم المستشرق: مايرهوف،
بدراسة تأثيره على كتب الطب في أوروبا.
ويذكر حنين في مقدمة هذا
الكتاب أن كتابه هو ثمرة خبرته في طب العين طوال ثلاثين سنة، ويضم هذا الكتاب عشر
مقالات في العين، عن طبيعة العين، وتركيبها، وعن العصب الباصر والروح الباصرة
والإبصار كيف يكون؟ وعن طبيعة الدماغ ومنافعه، وعن جمل الأشياء التي لا بد منها في
حفظ الصحة واختلافها، وعن أسباب الأعراض الكائنة في العين، وعن قوى جميع الأدوية
عامة، وعن علامات الأمراض التي تحدث في العين، وعن أجناس الأدوية للعين وأنواعها،
وعن مداواة أمراض العين، وعن الأدوية المركبة الموافقة للعين، وعن علاج أمراض
العين بالعمل الجراحي، وقد تُرجِم هذا الكتاب إلى اللغة اللاتينية مرتین.
وله: في اختيار أدوية العين، وكتاب في الرمد، وكتاب في العين
أو الحجة أو الجواب أو المسائل في العين، وقد صنَّفه على طريقة السؤال والجواب
لولديه داود وإسحاق،
وله كتاب في تركيب العين وعللها وعلاجها.
وله في الطب:
المسائل في الطب، أو المسائل، وهو المدخل إلى صناعة الطب في زمانه؛ لأنه جمع فيه
المبادئ والأوائل في الطب، وقد شاركه في إعداد هذا الكتاب ابن أخته وتلمیذه حبیش بن الأعسم، وتممه له عندما کان حنين مشغولًا کطبیب خاص للمتوکل ورئيس للأطباء في
بغداد، ولأهمية هذا الكتاب شرحه كثير من الأطباء الذين جاءوا بعد حنين،
ومنهم ابن النفيس، والرحبي،
واللبودي، وابن
المنفاخ، والنيلي، والدخوار، وابن دقيق،
وابن أبي صادق.
وله: تحفة الألِبَّاء وذخيرة الأطباء، وامتحان الأطباء،
والنكاح، و فيمن يولد
لثمانية أشهر، وكتاب في أن الطبيب
الفاضل لا بد أن يكون فيلسوفًا، و في حفظ الأسنان واللثة
واستصلاحهما، وكتاب المدخل إلى الطب، ورسائل في الدغدغة، وفي أوجاع المعدة، وفصول حنين في أشربة وأدوية مختارة، وفي تدبير الصحة في المطعم
والمشرب، وفي البقول وحواشيها، ومقالة: في ماء البقول، و في الفواكه ومنافعها، وفي
إصلاح ماء الجبن ومنافعه وما يستعمل منه، والتذكرة المأمونية في منافع الأغذية، و"الأغذية"، و"آلات الأغذية وتدبيرها"
وأمر الدواء المسهل، والفرق بين الغذاء والدواء المسهل، ومقالة: في تولد الحصاة.
وله موسوعة عن أعلام الأطباء هو تاريخ الأطباء، وله كتب
في الصيدلة هي: (في أسماء الأدوية المفردة على حروف المعجم)، و: (في أسرار الأدوية
المركبة)، و: (في الأدوية المحرقة)، و: (خواص الأدوية المفردة)، و(أقرباذين)
ولحنين مؤلفات في علوم
أخرى منها: (مختصر في تاريخ الكيميائيين)، و: (مقالات) و: (في السبب الذي من أجله صارت مياه البحر مالحة)، و (في المد
والجزر)، و (في تولد النار بين الحجرين)، ورسائل: (في الضوء وحقيقته)، و (في
الأوزان والأكيال). و (مقتطفات من رسالة المذنبات)، و (في ذوات الذنب)، و (ألفاظ
الفلاسفة في الموسيقى ونوادر فلسفية)، و (القول فيما يستجيب ولا يستجيب من شهور
السنة)، و (مجالس الحكماء)، و(اجتماعات الفلاسفة في بيت الحكمة في الأعياد وتفاوض
الحكمة بينهم)، و (آداب الفلاسفة)، و (كتاب في المنطق)، و (كتاب في النحو) و (كتاب
في أفعال الشمس والقمر)، وتراجم حنين عديدة لجالينوس وبقراط
وديسقوريدس وأرسطوطاليس
وإقليدس وأبولينوس
وثیودوسیوس وبطلیموس،
وبلناس.
ومن أهم الكتب الفريدة
التي ترجمها حنين: الرسالة الشافية في أدوية
النسيان، وهي خاصة بثمر البلاذر المخصص لتنشيط الذاكرة.