تعتمد وزارة الأوقاف المصرية منظومة حوكمة دقيقة تبدأ من التحصيل عبر حساب موحد بالبنك المركزي، وصولاً إلى الرقابة الميدانية. ويتضمن البروتوكول المشترك مع وزارة التضامن الاجتماعي آليات متطورة للتحقق؛ حيث تخضع كشوف المستحقين لمراجعة داخلية وفحص عشوائي (ميداني وهاتفي) من خلال الإدارة العامة للحوكمة، مما يضمن أعلى درجات الشفافية في إدارة الأموال العامة، والتأكد اليقيني من وصول الدعم الغذائي لمستحقيه بالأسر الأولى بالرعاية بجميع المحافظات.